南區國稅局表示，ETC通行費繳納方式主要有預先儲值扣款及事後補繳兩種方式，前者是先行購買IC儲值卡，實際通行費由儲值卡自動扣款，後者則是收到通行費補繳通知後再行繳納；營利事業列報ETC通行費時，應注意按不同的繳納方式取具憑證：

一、預先儲值扣款

營利事業購買（或加值）IC儲值卡時，應取具遠通公司直營門市或指定通路商開立之代收收據，如以刷卡方式購買者，得以銀行寄發之信用卡扣款對帳單作為繳款憑證。但購買（或加值）IC儲值卡是屬於預付性質，實際使用高速公路部分之通行費才能列報為當年度費用，實際使用高速公路證明包括經手人或出差人證明（適用於企業車主或個人證明）、遠通公司寄送之通行紀錄表（適用於企業客戶）。至當年度結束時尚未實際使用部分，就不能列報為當年度費用，而應列為預付費用。

二、事後補繳通行費

若是到遠通公司直營門市或指定通路商以現金繳費者，應取具代收收據，若採銀行帳戶扣款或刷卡繳費，得以銀行寄發之銀行帳戶或信用卡對帳單作為繳款憑證。另外，採用事後補繳者，如遠通公司額外收取通知補繳作業處理費，則應取具遠通公司開立之統一發票，以憑核認。

該局提醒營利事業注意，所列報之通行費除應取得前揭憑證外，尚應與經營本業及附屬業務有關，才得以列報費用。

[精宸註釋]ETC通行費應取具之憑證

一、預先儲值扣款

(1)現金繳納：遠通公司直營門市或指定通路商開立之代收收據

(2)刷卡繳納：得以銀行寄發之信用卡扣款對帳單作為繳款憑證

(3)經手人或出差人證明（適用於企業車主或個人證明）、遠通公司寄送之通行紀錄表（適用於企業客戶）

列報通行費＝(1)+(3)或者(2)+(3)

二、事後補繳通行費

(1)現金繳納：遠通公司直營門市或指定通路商之代收收據

(2)銀行帳戶扣款或刷卡繳費：得以銀行寄發之銀行帳戶或信用卡對帳單作為繳款憑證

(3)遠通公司額外收取通知補繳作業處理費，則應取具遠通公司開立之統一發票

列報通行費=(1)+(3)或者(2)+(3)